Status prawny Naczelnika Urzędu Skarbowego i kierowanego przez niego Urzędu regulują:

• Ustawa z dnia 16 listopada 2016 r. o Krajowej Administracji Skarbowej,
• Zarządzenie Ministra Rozwoju i Finansów z dnia 1 marca 2017 r. w sprawie organizacji jednostek organizacyjnych Krajowej Administracji Skarbowej oraz nadania im statutów,
• Zarządzenie Nr 4/2017 Dyrektora Izby Administracji Skarbowej w Zielonej Górze z dnia 07 marca 2017r.  w sprawie nadania Regulaminu organizacyjnego Urzędowi Skarbowemu w Krośnie Odrzańskim.

Zgodnie z art. 11 ust. 1 ustawy z dnia 16 listopada 2016 r. o Krajowej Administracji Skarbowej, Naczelnik Urzędu Skarbowego jest organem Krajowej Administracji Skarbowej.
Naczelnik Urzędu Skarbowego jest organem administracji rządowej niezespolonej i podlega Ministrowi właściwemu do spraw finansów publicznych.