Terytorialny zasięg działania Urzędu Skarbowego w Międzyrzeczu został określony w przepisach rozporządzenia Ministra Rozwoju i Finansów z dnia 24 lutego 2017 r. w sprawie  terytorialnego zasięgu działania oraz siedziby dyrektorów izb administracji skarbowej, naczelników  urzędów skarbowych, naczelników urzędów celno-skarbowych oraz siedziby dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej i obejmuje:

• powiat; międzyrzecki obejmujący miasta: Międzyrzecz, Skwierzynę, Trzciel;
• gminy: Bledzew, Międzyrzecz, Przytoczna, Pszczew, Skwierzyna i Trzciel.